紫外線消毒器燈管通過波長在240～270mm的紫外線對水中微生物體進行一定時照射，使細菌或病毒中維持生命的主要構成成分核原蛋白中的核酸分子，因大量吸收紫外線就會發生性變，從而破壞了其生理活性，使其吸收的能量達到致死量，細菌便大量地死亡。其殺菌后的水質均可達到國家規定的生活飲用水衛生標準。